Коллективу ФМБА России

Уважаемые коллеги!

Примите самые искренние поздравления по случаю 75-летия Федерального медикобиологического агентства!

Сегодня вы сохраняете славные традиции служения российской медицинской науке и отечественному здравоохранению. Ваш безграничный талант и колоссальный опыт стали залогом высоких результатов ФМБА.

Пусть ваша жизнь будет насыщена яркими событиями и знаменательными достижениями!

Желаем вам крепкого здоровья, новых идей, успехов в вашем благородном деле!

С уважением, Юрий ЛОБЗИН, президент, заслуженный деятель науки РФ, академик РАН,

Александр УСКОВ, директор, и коллектив ФГБУ ДНКЦИБ ФМБА России

Klebsiella pneumoniae

Klebsiella pneumoniae (клебсиелла) является одним из самых значимых возбудителей госпитальных инфекций, роль которого растет с каждым годом в связи с прогрессированием распространения антибиотикорезистентности, а также с ростом вирулентности внутрибольничных генетических линий. Ежегодно в России от внутрибольничных инфекций, вызванных K. Pneumoniae, погибают более 20 тысяч пациентов. В НИО медицинской микробиологии и молекулярной эпидемиологии собрана уникальная коллекция внутрибольничных клебсиелл и близких видов от пациентов с тяжелыми госпитальными инфекциями, которая является основой для нескольких главных направлений научно-исследовательской работы.

Первое направление — молекулярная эпидемиология. Еще в 2013 году было показано, что распространение супербактерий с геном blaNDM-1 в Санкт-Петербурге носит преимущественно моноклональное происхождение, после чего постепенно произошло увеличение разнообразия генетических линий. Были впервые в России описаны внутрибольничные Kpn, несущие гены KPC-2, характерные для Северной Америки, и другие детерминанты резистентности. В течение четырех лет ведется изучение гипервирулентных клебсиелл, собрана уникальная коллекция с огромным географическим размахом, применение новых подходов в секвенировании выводит сейчас исследования на новый методический уровень. Коллектив отдела на данный момент находится в числе мировых лидеров по изучению проблемы гипервирулентности у клебсиелл, в частности, благодаря успешному проекту, заложившему основу новому направлению — механизмы формирования успешных генетических линий множественно резистентных гипервирулентных Klebsiella pneumoniae, в ходе которого в течение трех лет детально изучались циркулирующие в онкологическом стационаре клебсиеллы, проведен анализ и связь между внутрибольничными генетическими линиями, клинической картиной, уровнем вирулентности на септической модели и генетическими характеристиками возбудителя. Помимо эпидемиологических направлений, также разрабатывается направление по моделированию различных режимов антимикробной терапии для изолятов с разным уровнем фенотипической резистентности. Получаемые данные дополняют классические представления о роли фармакодинамики и фармакокинетики в эффективности терапии, рассматривается такой принципиальный параметр, как стабильность уровня чувствительности к антибиотикам в процессе антимикробной терапии, и механизмы, лежащие в его основе. В отделе постоянно проходят практику и выполняют квалификационные работы студенты ведущих вузов Санкт-Петербурга, лучшие из которых остаются в коллективе отдела.

Streptococcus pneumoniae

Streptococcus pneumoniae — распространенный комменсал верхних дыхательных путей человека, но в то же время этот микроорганизм может вызывать серьезные заболевания, такие как пневмония, менингит, бактериемия, которые требуют серьезного лечения, а в некоторых случаях могут приводить к инвалидности и даже летальному исходу, причем наиболее уязвимы маленькие дети и пожилые люди. Основной способ борьбы с пневмококковыми инфекциями — вакцинация. Современные пневмококковые вакцины содержат полисахариды капсулы пневмококка — основного фактора его вирулентности, позволяющего преодолевать защитные механизмы организма человека.

Пневмококки синтезируют около 100 различных типов капсулы, вызывающих специфический иммунный ответ, к тому же под воздействием вакцинации соотношение пневмококков с разными типами капсул — серотипами — меняется: доля включенных в вакцину снижается, а невакцинных — возрастает. Таким образом, разработка новых пневмококковых вакцин представляет собой важную и непростую научную и технологическую задачу.

Изучение S. pneumoniae в нашем отделе ведется по двум основным направлениям:

• исследование динамики серопейзажа пневмококков у детей младшего возраста в Санкт-Петербурге и других регионах Российской Федерации с целью оценки эффективности антипневмококковой вакцинации и выработки рекомендаций по серотиповому составу пневмококковой вакцины нового поколения;

• исследование генетической структуры пневмококковой популяции с целью выявления новых вирулентных генетических линий, а также поиска мишеней для создания новой пневмококковой вакцины, не зависящей от серотипового состава микробной популяции.

В работе мы применяем как классические бактериологические методы исследования микроорганизмов, так и современные молекулярные, такие как метод полимеразной цепной реакции в реальном времени, секвенирование, в том числе полногеномное. Коллектив состоит как из опытных специалистов, так и способных молодых исследователей. Мы уверены, что наши исследования создают фундамент для разработки эффективной и безопасной отечественной пневмококковой вакцины.

Staphylococcus aureus

Устойчивость к антибиотикам является одной из наиболее серьезных проблем современной медицины, приводящей к высоким рискам неблагоприятных исходов, включая летальность, при инфекционных заболеваниях. Особую озабоченность вызывает группа нозокомиальных патогенов, в которую входит Staphylococcus aureus, важнейшим фенотипом которого являются метициллинрезистентные стафилококки (MRSA), проявляющие устойчивость ко всем бета-лактамным антибиотикам. В последние годы установлено, что MRSA связаны с инфекционными заболеваниями не только человека, но и животных. Понимание механизмов формирования устойчивости и распространения золотистого стафилококка, поиск возможных путей воздействия и сдерживания распространения являются важнейшими научно-практическими задачами, стоящими перед мировой системой здравоохранения. В связи с этим работа по изучению молекулярной эпидемиологии, устойчивости к антибиотикам, экспериментальное моделирование устойчивости Staphylococcus aureus бесспорно являются актуальным и значимым научно-практическим направлением отдела.

Проведен молекулярно-генетический анализ штаммов S. aureus, выделенных на территории Российской Федерации. Были определены доминирующие клоны, ассоциированные как с нозокомиальными штаммами, так и внебольничными. Впервые установлены генетические связи относительно глобальной популяции S. aureus. За последние пять лет издано более 20 публикаций, включая шесть международных, входящих в первый квартиль, получено три гранта РНФ.

Новый метод лечения

Внедрение методов метагеномного секвенирования (клинической метагеномики) в клинико-диагностический процесс для диагностики как новых, так и известных вирусных и бактериальных инфекций. Фундаментом этого являются научные работы следующих направлений. Первое, это изучение микробиоты верхних и нижних дыхательных путей у пациентов с новой коронавирусной инфекцией COVID-19. Второе — изучение нового терапевтического направления, связанного с фекальной трансплантацией у больных с лейкозами после аллогенной трансплантации костного мозга и осложнением РТПХ. По результатам работ этого направления сотрудники отдела в 2022 году были удостоены престижной медицинской премии «Призвание» в номинации «Новый метод лечения».

Сергей СИДОРЕНКО, заведующий научноисследовательским отделом медицинской микробиологии и молекулярной эпидемиологии