Сегодня Тверской государственный медицинский университет имеет шесть факультетов — лечебный, стоматологический, педиатрический, фармацевтический, клинической психологии и высшего сестринского образования. Здесь осуществляется подготовка кадров высшей квалификации в ординатуре, аспирантуре и докторантуре.

Университет является площадкой целевого обучения для девяти регионов РФ, а также осуществляет подготовку высококвалифицированных кадров на основе договоров о целевом приеме для Федеральной службы исполнения наказаний, Федерального медико-биологического агентства, Министерства внутренних дел РФ и ОАО «Российские железные дороги».

В рамках дополнительного профессионального образования реализуются около 100 программ повышения квалификации и профессиональной переподготовки для практикующих врачей. Ежегодно программы повышения квалификации и (или) профессиональной переподготовки проходят около 1 000 человек.

В Тверском ГМУ по различным образовательным программам обучаются более 5 000 человек, из них около 1 500 иностранных граждан из 47 стран.

В 2023 году в структуру университета вошла гимназия, реализующая образовательные программы основного общего и среднего общего образования. В гимназии выбран естественно-научный профиль обучения, который ориентирует на такие сферы деятельности, как медицина, биотехнологии. Здесь обучаются около 100 человек.

Реализацию дополнительных общеразвивающих программ по подготовке к поступлению в медицинский вуз обеспечивает Центр довузовской подготовки и профориентационной работы.

Тверской медуниверситет — единственный вуз в регионе, который организовал дистанционные курсы по подготовке к ЕГЭ. Подготовительными курсами ежегодно пользуются более 200 слушателей из разных регионов России.

Стоматологическая поликлиника является лечебно-профилактическим учреждением, с 1955 года оказывает все виды медицинской стоматологической помощи жителям Твери, Тверской области, всех регионов РФ. На ее территории базируются все стоматологические кафедры университета.

В структуру университета входят также научно-исследовательские подразделения, управление информационных технологий, мультипрофильный аккредитационно-симуляционный центр, оснащенный современными фантомами, тренажерами и симуляторами, служба по целевой подготовке и содействию трудоустройству выпускников, управление по воспитательной работе и другие.